Questo accade se il simulatore non è stato chiuso appropriatamente, ad esempio per una interruzione di corrente o, più probabilmente, perchè ha crashato. al successivo avvio ti propone il messaggio del quale hai parlato. Non ho idea di cosa succeda riavviandolo in "safe mode", probabilmente avrà delle funzionalità limitate. Io, tutte le volte che mi è successo ho riavviato in "normal mode", a quel punto lui fa tutto il suo ciclo di avviamento e poi parte tranquillamente.